Bioqu�mica (s)em rede

Cita��o da semana

Thu, 12 Mar 2009 09:31:51 +0000

"N�o se deixem cegar pelos livros. Tenham sempre as mentes abertas. Se as vossas experi�ncias disserem o contr�rio dos livros, confirmem, confirmem de novo e publiquem-no. Os livros podem estar errados."

Miguel Mota - O homem que sabia de mais em 1957 (p. 6 do caderno P2; em "stereo" com o "Que Universidade?")

Cita��o da semana

Mon, 02 Mar 2009 19:08:50 +0000

A university has its responsibility to the student as well as an obligation to add to knowledge. Let us not put our students in the position of observing or being a party to practices contrary to the ideal for a university and for his future career. If the student sees his institution engaged in fundamental research, freely supported and freely conducted, he will learn that independence in investigation is man's right and a university's responsibility to exemplify.
N. PAUL HUDSON, Ohio State University Graduate School Record, December 1951.

(Respigado da p. 314 da Science, vol. 123 (3191) de 1956, no final de um artigo de O. Warburg (On the origin of cancer cells), em "stereo" com o "Que Universidade?")

Curr�culo oculto

Fri, 14 Mar 2008 18:13:03 +0000

Para pensar durante as f�rias da P�scoa ...

[...]
Os alunos, para al�m da mat�ria, aprendem outras coisas [...]: aprendem que passar nos exames � muito mais importante que saber e ter curiosidade intelectual ou motiva��o pelo conhecimento; aprendem que obedecer ao professor e dizer-lhe o que este espera ouvir � muito mais rent�vel do que expressar as suas pr�prias opini�es; aprendem que, se se tornam demasiado vis�veis ou protestam em excesso, estar�o sujeitos a um maior controlo classificat�rio; aprendem que, se tiverem sorte, poder�o passar sem esfor�o; aprendem, em suma, um conjunto de truques que nada t�m a ver nem com a cultura, nem com a educa��o, nem com o prazer de saber e descobrir ...
[...]

Batalloso Navas, 2000. Citado em: M� Alfredo Moreira e Fl�via Vieira (2001) Princ�pios Reguladores da Pedagogia Universit�ria. CIEd - Livros de Actas, UMinho.

(Entrada em "stereo" com o Que Universidade?)

Lida da casa

Sun, 22 Jul 2007 11:15:36 +0000

N�o estranhem o sil�ncio; o blogue estar� parado, em princ�pio, at� ao in�cio das aulas em Setembro.

Stanley Miller (1930-2007)

Mon, 04 Jun 2007 18:32:32 +0000

Stanley Miller morreu recentemente (Stanley Miller, Who Examined Origins of Life, Dies at 77). Foi um dos pioneiros dos estudos bioqu�micos da origem da vida. Ficaram famosas as suas experi�ncias com descargas el�ctricas e outras fontes de energia em atmosferas cuja composi��o se tinha, na altura, por pr�xima da da atmosfera primitiva, recuperando-se em consequ�ncia mol�culas org�nicas que se tinham formado naquelas condi��es. (Miller-Urey experiment).

Bioqu�mica na imprensa

Tue, 22 May 2007 11:56:14 +0000

Um pequeno artigo na p�gina "online" do P�blico, datado de ontem, pode ser um bom exerc�cio de revis�o de conceitos b�sicos do metabolismo (e tamb�m para detectar os deslizes do/da jornalista). Aqui fica o texto, para o caso de a liga��o deixar de funcionar:

Pode criar novos f�rmacos contra obesidade e excesso de peso
Cientistas criam modelo virtual do mecanismo que regula queima de gordura
21.05.2007 - 15h58 PUBLICO.PT

Um estudo do Conselho Superior de Investiga��es Cientificas (CSIC) espanhol permitiu desenvolver um modelo virtual do mecanismo que regula a queima de gorduras no organismo. A investiga��o, publicada na revista cient�fica "Journal of Biological Chemistry", representa um avan�o importante para a cria��o de novos f�rmacos contra os casos mais graves de excesso de peso e de obesidade.

Os investigadores do CSIC, em parceria com o Centro de Biologia Molecular Severo Ochoa e com as universidade de Leon e de Barcelona, geraram um modelo virtual da estrutura da prote�na Carnitina palmitoiltransferase1 (CPT1), crucial no processo da queima de gordura. Sobre esta prote�na actuam as mol�culas Malonil-CoA, que acalma a sua actividade, e a L-carnitina, composto presente nos cosm�ticos e suplementos aliment�cios, que activa o seu funcionamento.

G�mez-Puertas, que dirigiu o estudo, explica que o modelo inclui informa��o sobre o segmento regulador da CPT1, completamente desconhecido at� agora, assim como os desenhos � escala at�mica do funcionamento repressor da Malonil-CoA.

"O novo modelo constitui o primeiro passo para o desenvolvimento no futuro de f�rmacos capazes de actuar contra os n�veis de acumula��o de gorduras e contra a sensa��o de apetite", refere o investigador do CSIC.

O bi�logo diz que "a prote�na CPT1 encontra-se dentro do organismo sobre tr�s formas diferentes: no f�gado e nos m�sculos, ambas implicadas nos processos relacionados com a diabetes tipo II e certas doen�as card�acas, e no c�rebro. Nesta �ltima, considera-se que a CPT1C � a respons�vel pela sensa��o de fome".

A prote�na CPT1 est� presente em muitos estudos internacionais sobre a obesidade. Por isso, � imprescind�vel conhecer de forma exaustiva o seu funcionamento antes de se iniciar o desenvolvimento de terapias contra os casos mais graves de obesidade e excesso de peso.

Cientistas criam modelo virtual do mecanismo que regula queima de gordura

*tentei encontrar o artigo referido no JBC, cuja refer�ncia deveria fazer parte do texto ("wishful thinking!"), mas n�o o consegui com base nos dados indicados; fica tamb�m como exerc�cio.

Frutose-2,6-bis-fosfato

Tue, 01 May 2007 11:34:39 +0000

O papel deste sub-produto do metabolismo glicol�tico na regula��o rec�proca da glic�lise e da gliconeog�nese, em conjun��o com o efeito do AMP, foram revelados em 1981, num curto artigo da autoria de dois belgas da Universidade de Lovaina:

E. van Schaftingen & H.-G. Hers (1981). Inhibition of Fructose-1,6-bisphosphatase by Fructose 2,6-bisphosphate. Proceeddings of the National Academy of Sciences USA 78: 2861-2863.

Colesterol e tubar�es

Wed, 25 Apr 2007 18:39:10 +0000

Durante a investiga��o sobre a s�ntese do colesterol, nos anos 50, Bloch passou uma temporada nas Bermudas. N�o em f�rias, mas em trabalho. Conta ele muitos anos mais tarde:

[...]
All I was able to learn was that sharks of manageable lenght are very difficult to catch and their oily livers impossible to slice
[...]

Quem disse que o trabalho de um bioqu�mico n�o pode ser perigoso? Esta liga��o aos tubar�es tamb�m explica o nome de um dos intermedi�rios na s�ntese: esqualeno vem de esqualo, um nome gen�rico para tubar�es.

KBloch (1987). Summing up. Annual Review of Biochemistry, 56: 1-18

Oxida��o dos �cidos gordos

Mon, 16 Apr 2007 18:05:56 +0000

A descoberta do destino dos �cidos gordos nas mitoc�ndrias de f�gado aconteceu ap�s o final da Segunda Guerra Mundial. Foi publicada por Albert Lehninger (sim, o autor do livro) e Eugene Kennedy em 1948. Umas palavras do referido artigo:

[...] The oxidation of n-octanoate in these suspensions was found to proceed according to the equation, C7H15COOH + 3 O2 --> 2 CH3COCH2COOH + 2 H2O. However, when the oxidation was allowed to take place in the presence of oxalacetate, the yield of acetoacetate diminished and citrate accumulated, implicating the Krebs tricarboxylic acid cycle in fatty acid oxidation in these enzyme preparations. The latter study also yielded some information as to certain features of the mechanism of fatty acid oxidation, supplementing the isotope studies of Weinhouse and his colleagues (3, 4) and Buchanan et al. (5). The gross mechanism of oxidation in the liver of the rat, at least, appears to involve the successive oxidative removal of 2-carbon units from the fatty acid. [...]
(op. cit., p. 753)

Albert L. Lehninger and Eugene P. Kennedy (1948). THE REQUIREMENTS OF THE FATTY ACID OXIDASE COMPLEX OF RAT LIVER. J. Biol. Chem. 173: 753-771.

L�pidos

Mon, 16 Apr 2007 11:42:51 +0000

Deixo aqui a liga��o para um "site" com informa��o geral sobre lipidos. Ser� �til para a revis�o das nomeclatura e estrutura dos compostos que v�o ser tema de pr�ximas aulas de Bioqu�mica II (beta-oxida��o e s�ntese dos �cidos gordos):

Lipids- Introduction

Beta-oxida��o dos �cidos gordos

Tue, 10 Apr 2007 15:56:49 +0000

Quem � que, no seu pefeito ju�zo, querer� aprender alguma coisa sobre a mat�ria referida no t�tulo? S� lhe falta cheirar a ran�o! (o que, de facto � algo que pode acontecer �s gorduras - o ran�o � causado por enzimas que degradam a gordura, tendo como resultado a liberta��o de �cidos gordos de cadeia curta, que causam sabores e cheiros indesej�veis). Pois �!

Como um est�mulo ao respectivo estudo (que vai come�ar na pr�xima semana, caros alunos de Bioqu�mica II), deixo aqui a liga��o para um artigo que mostra a conex�o entre o processo acima referido e a doen�a (naturalmente, em ingl�s, e s� acess�vel da rede da Universidade de Coimbra):

Tiina Tyni & Douglass M Turnbull (2001). Fatty Acid Oxidation Disorders. Enciclopedia of Life Sciences, Wiley.

Generalista ou especialista?

Thu, 05 Apr 2007 14:21:16 +0000

H� uma frase (batida) que liga as defini��es dos dois tipos de pessoas mencionados no t�tulo, se bem que de uma forma reducionista: um generalista � algu�m que sabe nada sobre tudo; um especialista � algu�m que sabe tudo sobre nada.
Num tempo de superespecializa��o, ser� que os generalistas, como Darwin, ainda t�m lugar? � uma reflex�o que deve ser feita por quem est� prestes a fazer uma escolha que pode levar a uma futura carreira cient�fica, quest�es econ�micas � parte. Para ajudar � reflex�o, deixo abaixo uma liga��o para um texto que pode funcionar como semente da dita; al�m de que d� uma perspectiva abrangente de muitos dos grandes problemas que se colocam � Biologia hoje. Mais um subs�dio para o pensamento lateral que "levou" alguns alunos a Aveiro um dia destes, 8-).

ESzathm�ry (2006). Darwin for all seasons. Science 313: 306-307.

A import�ncia das ideias

Wed, 04 Apr 2007 22:46:44 +0000

Fazendo um bocadinho de cita��o cruzada, que espero me perdoem, gostaria de chamar a aten��o para os extractos de textos de von Humboldt e de Max Weber, recentemente colocados no meu outro blogue:

von Humboldt (On the Spirit and the Organisational Framework of Intelectual Institutions in Berlin)

Weber (Science as a Vocation)

O segundo � especialmente importante para quem pretende seguir uma carreira na Ci�ncia.

Ci�ncia rom�ntica

Fri, 23 Mar 2007 15:02:31 +0000

[...]
That was the beginning, and the idea seemed so obvious to me and so elegant that I fell deeply in love with it. And, like falling in love with a woman, it is only possible if you do not know much about her, so you cannot see her faults. The faults will become apparent later, but after the love is strong enough to hold you to her. So, I was held to this theory, in spite of all difficulties, by my youthful enthusiasm.
[...]

Estranho? E se eu disser que o texto acima faz parte do discurso de Richard Feynman na recep��o do Pr�mio Nobel da F�sica em 1965?

The development of the space-time view of quantum electrodynamics

Ci�ncia pura e dura

Tue, 20 Mar 2007 18:47:02 +0000

No amount of experimentation can ever prove me right; a single experiment can prove me wrong.

Albert Einstein